Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbibQ60778 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfkbibQ60778 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbibQ60778 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms