Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samhd1Q60710 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samhd1Q60710 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms