Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TefmQ5SSK3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TefmQ5SSK3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms