Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Fam220aQ3ZN08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Fam220aQ3ZN08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Fam220aQ3ZN08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Fam220aQ3ZN08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Fam220aQ3ZN08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fam220aQ3ZN08 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam220aQ3ZN08 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fam220aQ3ZN08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Fam220aQ3ZN08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam220aQ3ZN08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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