Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
6430531B16RikQ3V2J1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
6430531B16RikQ3V2J1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
6430531B16RikQ3V2J1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
6430531B16RikQ3V2J1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
6430531B16RikQ3V2J1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
6430531B16RikQ3V2J1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms