Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms