Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
A530084C06RikQ3UTW2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms