Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Skap2Q3UND0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms