Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrch2Q3UMG5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch2Q3UMG5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch2Q3UMG5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms