Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam193bQ3U2K0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam193bQ3U2K0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms