Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmd1Q3TXS7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmd1Q3TXS7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmd1Q3TXS7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms