Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pnpla6Q3TRM4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnpla6Q3TRM4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pnpla6Q3TRM4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pnpla6Q3TRM4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pnpla6Q3TRM4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pnpla6Q3TRM4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pnpla6Q3TRM4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pnpla6Q3TRM4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms