Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jsrp1Q3MI48 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jsrp1Q3MI48 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jsrp1Q3MI48 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms