Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms