Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam171bQ14CH0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam171bQ14CH0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.3 ms