Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkpd1Q0VF94 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkpd1Q0VF94 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkpd1Q0VF94 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkpd1Q0VF94 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkpd1Q0VF94 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkpd1Q0VF94 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkpd1Q0VF94 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkpd1Q0VF94 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms