Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap5cQ0V8T7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms