Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cass4Q08EC4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cass4Q08EC4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cass4Q08EC4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms