Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbp2Q08652 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp2Q08652 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp2Q08652 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms