Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cab39Q06138 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms