Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tff2Q03404 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tff2Q03404 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff2Q03404 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms