Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcqQ02111 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcqQ02111 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms