Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sec23aQ01405 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23aQ01405 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms