Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9bP98195 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9bP98195 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9bP98195 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9bP98195 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp9bP98195 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms