Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lama4P97927 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lama4P97927 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama4P97927 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lama4P97927 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama4P97927 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms