Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms