Protein–RNA interactions for Protein: P97360

Etv6, Transcription factor ETV6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv6P97360 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv6P97360 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv6P97360 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Etv6P97360 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv6P97360 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv6P97360 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv6P97360 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Etv6P97360 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv6P97360 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv6P97360 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv6P97360 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms