Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp8a1P70704 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp8a1P70704 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp8a1P70704 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms