Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SnrpnP63163 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpnP63163 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms