Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps27aP62983 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps27aP62983 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms