Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmc5P62196 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc5P62196 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms