Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psme3P61290 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psme3P61290 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psme3P61290 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms