Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abce1P61222 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abce1P61222 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abce1P61222 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Abce1P61222 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abce1P61222 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abce1P61222 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abce1P61222 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abce1P61222 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abce1P61222 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abce1P61222 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms