Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad23bP54728 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad23bP54728 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms