Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rad23aP54726 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad23aP54726 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad23aP54726 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.8 ms