Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fdft1P53798 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fdft1P53798 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms