Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr1cP52432 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms