Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn1cP49919 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn1cP49919 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms