Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox8bP48772 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox8bP48772 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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