Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VdrP48281 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VdrP48281 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VdrP48281 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VdrP48281 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VdrP48281 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VdrP48281 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VdrP48281 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VdrP48281 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VdrP48281 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VdrP48281 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VdrP48281 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VdrP48281 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VdrP48281 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VdrP48281 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VdrP48281 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VdrP48281 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VdrP48281 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VdrP48281 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VdrP48281 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VdrP48281 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VdrP48281 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VdrP48281 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VdrP48281 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VdrP48281 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VdrP48281 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VdrP48281 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VdrP48281 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VdrP48281 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VdrP48281 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VdrP48281 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VdrP48281 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms