Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprkP35822 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprkP35822 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprkP35822 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprkP35822 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprkP35822 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprkP35822 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprkP35822 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprkP35822 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprkP35822 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprkP35822 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprkP35822 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprkP35822 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprkP35822 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprkP35822 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms