Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pola1P33609 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pola1P33609 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pola1P33609 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pola1P33609 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pola1P33609 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pola1P33609 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pola1P33609 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms