Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nedd1P33215 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms