Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd12P23812 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms