Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf271P15620 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf271P15620 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf271P15620 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf271P15620 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf271P15620 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf271P15620 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf271P15620 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf271P15620 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf271P15620 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms