Protein–RNA interactions for Protein: P13541

Myh3, Myosin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh3P13541 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myh3P13541 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myh3P13541 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myh3P13541 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh3P13541 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh3P13541 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh3P13541 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh3P13541 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh3P13541 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh3P13541 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh3P13541 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh3P13541 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh3P13541 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh3P13541 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh3P13541 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh3P13541 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh3P13541 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh3P13541 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh3P13541 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh3P13541 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh3P13541 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh3P13541 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms