Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb2P13373 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms