Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spp1P10923 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spp1P10923 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms