Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spta1P08032 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spta1P08032 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spta1P08032 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spta1P08032 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms