Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01789 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01789 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01789 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01789 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01789 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01789 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01789 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01789 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01789 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01789 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01789 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01789 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01789 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01789 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01789 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01789 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01789 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01789 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01789 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01789 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01789 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01789 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01789 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01789 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01789 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01789 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms